Licenciado en Historia, Universidad Católica de Valparaíso. Doctor en Historia de América, Universidad de Sevilla, España. Desde 1971 se desempeña como profesor de Historia Contemporánea en la Pontificia Universidad Católica de Chile. También es investigador del Centro de Estudios Públicos (CEP). Joaquín Fermandois fue Presidente de la Comisión de Historiadores que asesoró a la Agencia del Ministerio de Relaciones Exteriores de Chile.